北京醫(yī)學院附屬中學創(chuàng)建于1960年，主校區(qū)位于海淀區(qū)花園北路40號，毗鄰北京大學醫(yī)學部、學院路八大學院等高等學府，目前正在進行重建，臨時校區(qū)位于牡丹園東里2號。北醫(yī)附中是海淀區(qū)一所教育、教學質(zhì)量較高、社會聲譽良好的完全中學，?2017年9月成為北大附中教育集團總校一員。北醫(yī)附中借助北大附中、北京大學、北大醫(yī)學部的教育資源，并且結(jié)合傳統(tǒng)文化方面的優(yōu)勢逐步形成了以生化和傳統(tǒng)文化為主的辦學特色。

學校在辦學理念上繼承了北京大學以奉獻社會為己任的擔當精神和北大醫(yī)學部嚴謹認真的敬業(yè)精神。，“關(guān)注人，培養(yǎng)人，成就人，發(fā)展人”尊重、適合、和諧、發(fā)展”是我校辦學思想的高度概括，是一所滿懷責任心、愛心、具有人文情懷的學校。

在辦學目標上，由于北醫(yī)附中坐落于海淀區(qū)東部教育核心地區(qū)，周邊高等院校、科研單位、成熟社區(qū)眾多，我校辦學目標秉承地理位置的優(yōu)勢和與高等院校、集團學校的聯(lián)合，努力成為海淀區(qū)東部一所家長滿意、學生向往、引領(lǐng)社區(qū)文化發(fā)展的學校，培養(yǎng)有愛國情懷、敬業(yè)精神的優(yōu)秀公民。

在辦學優(yōu)質(zhì)特色上，2015年5月15日，北大附中正式承辦北醫(yī)附中。2017年北大附中教育集團總校成立，北醫(yī)附中成為集團校一員。以集團化辦學的力量助推北醫(yī)附中的發(fā)展，學校充分利用名校的優(yōu)質(zhì)教育教學資源，不斷提高學校的整體實力，學校在教育教學等多個方面進行充分的改革，由此學校正式進入發(fā)展的快車道。我校將保持北醫(yī)原有的傳統(tǒng)文化特色，融合北大附中創(chuàng)新的辦學理念，以及北大醫(yī)學部“求醫(yī)問學”的精神，最終確立新契機下北京醫(yī)學院附屬中學的辦學優(yōu)質(zhì)特色項目，即大力開展傳統(tǒng)文化課程以及以醫(yī)療為背景的生化特色課程。

學校先后被授予“北京市文明禮儀示范?！薄ⅰ氨本┦行@文明示范?！薄ⅰ昂５韰^(qū)文明單位”、“海淀區(qū)科技教育示范學?！薄ⅰ昂５韰^(qū)課堂德育先進單位”、“海淀區(qū)非遺傳承項目基地?！薄ⅰ昂５韰^(qū)足球?qū)嶒瀸W?！钡确Q號。